Perché il Bacillus Subtilis è così ampiamente utilizzato? PARTE 3

"Il lavoro degli ultimi anni ha trasformato la nostra visione di cosa B. subtilis può fare all'interno del tratto gastrointestinale degli animali. Nel passato, B. subtilis si pensava fosse un aerobio obbligato che transitava semplicemente attraverso il tratto gastrointestinale prevalentemente anaerobico come spora. Pertanto, si pensava che qualsiasi beneficio derivante dal suo consumo fosse dovuto a qualche proprietà intrinseca della spora. Prove recenti, tuttavia, lo suggeriscono B. subtilis può completare il suo interociclo vitale all'interno del tratto gastrointestinale passando dalla spora alla cellula vegetativa e di nuovo allo sporulato. In effetti, la crescita all'interno del tratto gastrointestinale deve essere abbastanza robusta da poter competere con agenti patogeni simili E. coli nel tratto gastrointestinale del pollame se somministrato per via orale." In sintesi, i dati attuali lo suggeriscono B.subtilis' l'apparente ubiquità non è solo una conseguenza della persistenza delle spore in questi ambienti. Invece B. subtilis sembra crescere in ambienti diversi, compresi i suoli, sulle radici delle piante e all'interno del tratto gastrointestinale degli animali. (Conte, Losick, Kolter, 2008).

Oggi ci troviamo in un'epoca d'oro della genomica grazie a metodi sempre più facili per generare, assemblare e analizzare grandi quantità di informazioni di sequenza 23. Non abbiamo più bisogno di fare affidamento esclusivamente sulla geografia dell'isolamento, sui comportamenti in laboratorio o su resoconti aneddotici per raccogliere un quadro dell'ecologia di una specie. Inoltre, possiamo studiare i geni presenti o assenti in qualsiasi ceppo di interesse. L'identità delle proteine ​​previste per essere codificate nel genoma di un organismo può rivelare molto sullo stile di vita di quell'organismo e sugli habitat in cui risiede. (Conte, Losick, Kolter, 2008).

Infine, sembra che la trasformazione possa davvero aiutare a guidare l'evoluzione di B. subtilis. In condizioni di laboratorio, i ceppi possono assorbire e ricombinare il DNA genomico aggiunto esogenamente dai parenti 58. Ciò può verificarsi anche tra sottospecie sebbene il numero di ricombinanti diminuisca man mano che diminuisce la parentela, un fenomeno chiamato isolamento sessuale 58. Anche i primi esperimenti che utilizzavano microcosmi di terreno sterilizzato monitoravano cosa accadeva quando venivano mescolate varianti di ceppi differenzialmente "marcate" 59. Tale scambio è stato osservato anche tra specie diverse, ad es B. subtilis E B. licheniforme 60. Tuttavia, i risultati osservati sono stati probabilmente influenzati dalla scelta dei ceppi poiché entrambi i ceppi di laboratorio utilizzati sono noti per essere molto più altamente trasformabili rispetto ai ceppi selvatici. Anche i ricombinanti delle "specie ibride" erano instabili, suggerendo che i risultati potrebbero non essere rilevanti per ciò che sta accadendo in natura. Sembra, tuttavia, che le popolazioni selvatiche di B. subtilis ricombinano davvero i loro geni in natura 30. Il modo in cui questo scambio è mediato – per trasformazione, trasduzione o coniugazione – è ancora da determinare. (Conte, Losick, Kolter, 2008).

In sintesi, B. subtilis è una specie batterica ampiamente adattata, in grado di crescere all'interno di una miriade di ambienti tra cui il suolo, le radici delle piante e il tratto gastrointestinale degli animali. IL B. subtilis La sequenza del genoma 168 è stata uno strumento importante per aiutare la nostra comprensione di come sia possibile la crescita all'interno di alcuni di questi ambienti. Ora è chiaro, tuttavia, che il B. subtilis Il genoma 168 non racconta l'intera storia. Le analisi M-CGH hanno rivelato una grande variabilità tra i geni dei diversi membri della specie. (Conte, Losick, Kolter, 2008).

Earl, AM, Losick, R., & Kolter, R. (2008). Ecologia e genomica di Bacillus subtilis. Tendenze in microbiologia, 16(6), 269–275. https://doi.org/10.1016/j.tim.2008.03.004.